Service administratif et scientifique du Département de l’Yonne, les Archives départementales assurent la collecte, le classement et la description, la conservation et la mise à disposition du plus grand nombre du patrimoine écrit du département, tant public que privé.

Elles font partie du réseau d'archives publiques contrôlé par le service interministériel des Archives de France. La direction assure par ailleurs, par délégation préfectorale, le contrôle scientifique et technique de l’État sur les archives publiques.